Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2IP36954 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms