Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFC4P35249 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFC4P35249 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFC4P35249 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFC4P35249 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFC4P35249 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC4P35249 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC4P35249 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC4P35249 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC4P35249 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC4P35249 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC4P35249 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC4P35249 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC4P35249 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC4P35249 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC4P35249 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC4P35249 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC4P35249 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC4P35249 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC4P35249 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC4P35249 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC4P35249 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC4P35249 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC4P35249 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC4P35249 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC4P35249 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC4P35249 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC4P35249 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC4P35249 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC4P35249 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC4P35249 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC4P35249 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC4P35249 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC4P35249 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC4P35249 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC4P35249 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC4P35249 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC4P35249 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC4P35249 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC4P35249 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC4P35249 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFC4P35249 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms