Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNB1P35222 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms