Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPC1P35052 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPC1P35052 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPC1P35052 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GPC1P35052 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GPC1P35052 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GPC1P35052 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GPC1P35052 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GPC1P35052 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms