Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF1P30408 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms