Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms