Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms