Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3RAP26951 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms