Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKCHP24723 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms