Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRBP23467 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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