Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KB1P23443 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms