Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA6P23229 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms