Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCL3P20749 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCL3P20749 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCL3P20749 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCL3P20749 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BCL3P20749 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCL3P20749 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCL3P20749 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BCL3P20749 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCL3P20749 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCL3P20749 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCL3P20749 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCL3P20749 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCL3P20749 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCL3P20749 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCL3P20749 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCL3P20749 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BCL3P20749 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCL3P20749 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCL3P20749 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCL3P20749 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BCL3P20749 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCL3P20749 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCL3P20749 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCL3P20749 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCL3P20749 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms