Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms