Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB3P16520 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms