Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms