Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms