Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC175P0C221 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms