Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C4AP0C0L4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms