Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP10P09238 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP10P09238 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP10P09238 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP10P09238 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP10P09238 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP10P09238 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP10P09238 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP10P09238 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP10P09238 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP10P09238 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP10P09238 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP10P09238 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP10P09238 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP10P09238 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP10P09238 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP10P09238 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP10P09238 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP10P09238 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP10P09238 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP10P09238 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP10P09238 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP10P09238 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP10P09238 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP10P09238 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP10P09238 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP10P09238 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP10P09238 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP10P09238 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP10P09238 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP10P09238 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP10P09238 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP10P09238 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP10P09238 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP10P09238 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP10P09238 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP10P09238 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP10P09238 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP10P09238 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP10P09238 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP10P09238 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP10P09238 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP10P09238 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP10P09238 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP10P09238 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP10P09238 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP10P09238 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP10P09238 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP10P09238 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP10P09238 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP10P09238 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP10P09238 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP10P09238 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP10P09238 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP10P09238 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP10P09238 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP10P09238 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP10P09238 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP10P09238 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP10P09238 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP10P09238 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP10P09238 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP10P09238 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP10P09238 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP10P09238 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP10P09238 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP10P09238 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP10P09238 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP10P09238 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP10P09238 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMP10P09238 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP10P09238 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP10P09238 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP10P09238 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP10P09238 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP10P09238 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP10P09238 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP10P09238 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP10P09238 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP10P09238 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP10P09238 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP10P09238 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP10P09238 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP10P09238 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP10P09238 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP10P09238 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP10P09238 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP10P09238 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP10P09238 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP10P09238 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP10P09238 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP10P09238 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms