Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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