Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFMP07197 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFMP07197 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFMP07197 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFMP07197 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFMP07197 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFMP07197 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFMP07197 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFMP07197 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFMP07197 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFMP07197 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFMP07197 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFMP07197 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFMP07197 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFMP07197 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFMP07197 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFMP07197 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFMP07197 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFMP07197 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFMP07197 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFMP07197 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFMP07197 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFMP07197 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFMP07197 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFMP07197 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFMP07197 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFMP07197 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFMP07197 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFMP07197 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFMP07197 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFMP07197 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFMP07197 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFMP07197 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFMP07197 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEFMP07197 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEFMP07197 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEFMP07197 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEFMP07197 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEFMP07197 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEFMP07197 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEFMP07197 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEFMP07197 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEFMP07197 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEFMP07197 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFMP07197 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFMP07197 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFMP07197 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFMP07197 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFMP07197 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFMP07197 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFMP07197 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFMP07197 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFMP07197 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFMP07197 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFMP07197 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFMP07197 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFMP07197 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFMP07197 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFMP07197 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFMP07197 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFMP07197 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFMP07197 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFMP07197 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFMP07197 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFMP07197 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFMP07197 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFMP07197 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFMP07197 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFMP07197 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFMP07197 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFMP07197 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFMP07197 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEFMP07197 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms