Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3DP05423 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms