Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGKV3-15P01624 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms