Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFNB1P01574 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFNB1P01574 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms