Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDE8BO95263 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE8BO95263 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms