Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN7O94888 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms