Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F6O75461 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F6O75461 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F6O75461 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F6O75461 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F6O75461 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F6O75461 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F6O75461 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F6O75461 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F6O75461 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F6O75461 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F6O75461 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F6O75461 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F6O75461 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F6O75461 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F6O75461 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F6O75461 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F6O75461 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F6O75461 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F6O75461 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F6O75461 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F6O75461 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F6O75461 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F6O75461 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F6O75461 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F6O75461 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F6O75461 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F6O75461 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F6O75461 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F6O75461 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F6O75461 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F6O75461 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms