Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms