Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms