Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms