Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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HOXA3O43365 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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HOXA3O43365 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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HOXA3O43365 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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HOXA3O43365 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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HOXA3O43365 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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HOXA3O43365 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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HOXA3O43365 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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HOXA3O43365 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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HOXA3O43365 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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