Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms