Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLGNO14967 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLGNO14967 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLGNO14967 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms