Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2O14595 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2O14595 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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