Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF3FO00303 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF3FO00303 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF3FO00303 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF3FO00303 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF3FO00303 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF3FO00303 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF3FO00303 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF3FO00303 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF3FO00303 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF3FO00303 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF3FO00303 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF3FO00303 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF3FO00303 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF3FO00303 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF3FO00303 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF3FO00303 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF3FO00303 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms