Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQV1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQV1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQV1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQV1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQV1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQV1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQV1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQV1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQV1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQV1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQV1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQV1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQV1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQV1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQV1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQV1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQV1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQV1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQV1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQV1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQV1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQV1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQV1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQV1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQV1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQV1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQV1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQV1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQV1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQV1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQV1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQV1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQV1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQV1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQV1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQV1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQV1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQV1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQV1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQV1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQV1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQV1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQV1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms