Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms