Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L11C9JVI0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms