Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms