Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERVV-2B6SEH9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-2B6SEH9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms