Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4DXG7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
B4DXG7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DXG7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DXG7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DXG7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DXG7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DXG7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DXG7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DXG7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DXG7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DXG7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DXG7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DXG7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DXG7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DXG7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DXG7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DXG7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DXG7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DXG7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DXG7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DXG7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DXG7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DXG7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DXG7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DXG7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DXG7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DXG7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DXG7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DXG7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DXG7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DXG7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DXG7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DXG7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DXG7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DXG7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DXG7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DXG7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DXG7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DXG7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DXG7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DXG7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DXG7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DXG7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DXG7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
B4DXG7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
B4DXG7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
B4DXG7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms