Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms