Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL13PA6NNM8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms