Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALM3A6NDB9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms