Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms