Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
A0A0U1RQF3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms