Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LAPTM4AQ15012 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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LAPTM4AQ15012 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
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LAPTM4AQ15012 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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LAPTM4AQ15012 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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LAPTM4AQ15012 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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LAPTM4AQ15012 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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LAPTM4AQ15012 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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