RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410506.1

RNU6-1077P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1077, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1077P, Length 102 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CHIC1Q5VXU3 224 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-1077P-201ENST00000410506 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SLC24A1O60721 1099 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1077P-201ENST00000410506 EHMT2Q96KQ7 1210 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PLPPR3Q6T4P5 718 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KCNA4P22459 653 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CSRNP3Q8WYN3 585 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ADRA2BP18089 450 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZBTB22O15209 634 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TAOK2Q9UL54 1235 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-1077P-201ENST00000410506 BCANQ96GW7 911 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ARXQ96QS3 562 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PPP6R1Q9UPN7 881 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PLCB2Q00722 1185 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NPM3O75607 178 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FKBP8Q14318 412 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HOMEZQ8IX15 550 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FOXD1Q16676 465 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
RNU6-1077P-201ENST00000410506 VSIG10Q8N0Z9 540 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FOXD4L1Q9NU39 408 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa5.87□□□□□ -1.47
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ERICH6Q7L0X2 663 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DCAF8L2P0C7V8 631 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TMEM132AQ24JP5 1023 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PODXL2Q9NZ53 605 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-1077P-201ENST00000410506 C14orf37Q86TY3 774 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FBLN2P98095 1184 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-1077P-201ENST00000410506 APLP2Q06481 763 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DNAJC5BQ9UF47 199 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KLHL34Q8N239 644 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NBR1Q14596 966 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ATXN8OSP0DMR3 200 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MYT1Q01538 1121 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CFAP44Q96MT7 982 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-1077P-201ENST00000410506 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FBXO3Q9UK99 471 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PKD2Q13563 968 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-1077P-201ENST00000410506 UBTFP17480 764 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa5.46□□□□□ -1.54
RNU6-1077P-201ENST00000410506 VASPP50552 380 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SLC4A2P04920 1241 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HRCP23327 699 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-1077P-201ENST00000410506 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-1077P-201ENST00000410506 POTEDQ86YR6 584 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RNU6-1077P-201ENST00000410506 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MSH5O43196 834 aa5.31□□□□□ -1.56
RNU6-1077P-201ENST00000410506 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
RNU6-1077P-201ENST00000410506 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SPDYE4A6NLX3 237 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RGL2O15211 777 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CHGAP10645 457 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PROM2Q8N271 834 aa5.27□□□□□ -1.57
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ARID3AQ99856 593 aa5.27□□□□□ -1.57
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZBTB7CA1YPR0 619 aa5.26□□□□□ -1.57
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TRHP20396 242 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SPOCK2Q92563 424 aa5.25□□□□□ -1.57
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RSPH6AQ9H0K4 717 aa5.25□□□□□ -1.57
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NEUROD2Q15784 382 aa5.24□□□□□ -1.57
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZMYND15Q9H091 742 aa5.24□□□□□ -1.57
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DMRT2Q9Y5R5 561 aa5.24□□□□□ -1.57
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
RNU6-1077P-201ENST00000410506 LMOD2Q6P5Q4 547 aa5.21□□□□□ -1.58
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
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