Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDSNQ15517 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDSNQ15517 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDSNQ15517 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDSNQ15517 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDSNQ15517 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDSNQ15517 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDSNQ15517 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDSNQ15517 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDSNQ15517 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDSNQ15517 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDSNQ15517 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDSNQ15517 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDSNQ15517 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDSNQ15517 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDSNQ15517 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDSNQ15517 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDSNQ15517 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.6 ms